Los 10 mejores programas de facturación compatibles con WooCommerce
Elegir un buen programa de facturación para WooCommerce ya no va solo de “sacar PDFs bonitos”.
Hoy implica automatizar pedidos, evitar errores contables y cumplir con normativas como VeriFactu, TicketBAI, IVA intracomunitario o facturas rectificativas.
Si tu tienda online crece, tu facturación tiene que crecer con ella.
Antes de elegir software, conviene entender dos cosas clave:
→ WooCommerce no es un ERP: cuándo necesitas algo más
→ Cómo conectar WooCommerce con un programa de facturación
En esta guía repasamos los 10 programas de facturación y ERP que mejor encajan con WooCommerce, con un enfoque muy práctico para tiendas españolas. Además, te dejaremos varias guías relacionadas para que puedas profundizar desde cada punto.
1. Qué debe tener un buen programa de facturación para WooCommerce
Si quieres ver un ejemplo de integración completa (pedido → factura → envío → stock), aquí lo tienes:
→ Integrar WooCommerce con FacturaONE: automatiza tu facturación.
Y si quieres ver qué es FacturaONE y qué cubre como servicio (web, Android, WooCommerce, VeriFactu y TicketBAI), aquí tienes la visión general.
Antes del ranking, merece la pena aclarar qué deberías exigirle a cualquier solución:
- Integración real con WooCommerce
Que cree las facturas automáticamente al confirmarse el pedido, sincronice clientes y productos y respete series y numeraciones. - Cumplimiento normativo en España
IVA, IRPF, Recargo de Equivalencia, IGIC, intracomunitarias… y sobre todo, preparación para VeriFactu y, si operas en Euskadi, TicketBAI.
Aquí te conviene tener a mano la guía específica:
→ “¿Qué exige exactamente VeriFactu a tu software de facturación?”
→ “VeriFactu vs TicketBAI: diferencias explicadas”
Si vendes online, estos dos puntos son críticos:
→ WooCommerce y VeriFactu: lo que debes saber si vendes online
→ Errores de facturación en WooCommerce que pueden acabar en sanción
- ERP o, como mínimo, buena gestión de negocio
No basta con emitir una factura: necesitas controlar stock, compras, clientes, cobros, informes y, si es posible, contabilidad básica.
En B2B (bares, restaurantes, tiendas) los límites aparecen antes:
→ Usar WooCommerce para vender a clientes B2B
→ WooCommerce B2B: errores comunes al vender a empresas
- Automatización y estabilidad
Menos tareas manuales, menos errores, más tiempo para vender.
Automatizar sin romper la tienda también depende de rendimiento y SEO:
→ Cómo optimizar WooCommerce para SEO y rendimiento
→ Errores que hunden el SEO de un WooCommerce
Si quieres ver los errores típicos que comete la gente al elegir software, te será útil:
→ “Errores comunes al elegir programa de facturación”
2. Top 10 programas de facturación para WooCommerce
1. FacturaONE (España, integración nativa con WooCommerce)
Ideal para: autónomos, comercios y pymes que venden con WooCommerce y quieren automatizar de verdad la facturación.
FacturaONE conecta WooCommerce con un ERP completo en la nube. Cada pedido se convierte en factura (simplificada o completa), se respeta la serie, se actualiza el stock y se registran los impuestos según la normativa española. Preparado para VeriFactu y compatible con TicketBAI.
Funciones clave
- Integración directa WooCommerce ↔ FacturaONE
- Emisión automática de facturas y envío por email al cliente
- Preparado para VeriFactu y compatible con TicketBAI
- Gestión completa de productos, compras, stock, clientes y proveedores
- Control de cobros, vencimientos y remesas
- App Android + versión web 100 % cloud
- API REST para integraciones avanzadas
Por qué destaca
- Pensado específicamente para el mercado español
- Cumple normativa fiscal (IVA, IRPF, RE, IGIC, intracomunitarias…)
- Soporte rápido en español y sin depender de WordPress
Para profundizar:
→ “Programas de facturación que cumplen VeriFactu”
→ “Los 10 mejores programas de facturación y ERP”
→ “Cuándo es el momento de cambiar de programa de facturación”
2. Holded
Ideal para: pymes que buscan un ERP “todo en uno” conectado con la tienda online.
Holded es una plataforma de gestión empresarial con módulos de facturación, contabilidad, proyectos y CRM. Ofrece integración con WooCommerce y ha anunciado públicamente su adaptación a VeriFactu.
Puntos fuertes
- Interfaz moderna y amigable
- Gestión contable integrada
- Conexiones bancarias e informes avanzados
A tener en cuenta
- La integración con WooCommerce es buena, pero no tan específica como la de soluciones centradas en eCommerce
- El coste puede crecer a medida que añades usuarios y módulos
3. Odoo
Ideal para: empresas con equipo técnico propio o que trabajan con partner especializado.
Odoo es un ERP modular muy potente. La conexión con WooCommerce se hace mediante módulos/plug-ins adicionales y se puede extender a casi cualquier proceso interno.
Puntos fuertes
- Flexibilidad extrema: ventas, compras, almacén, fabricación, etc.
- Comunidad y ecosistema de módulos enorme
- Posibilidad de integrar VeriFactu a través de desarrollos o partners especializados
A tener en cuenta
- Requiere proyecto de implantación y mantenimiento
- Curva de aprendizaje alta
- Puede ser excesivo para negocios que “solo” necesitan facturar bien y cumplir con Hacienda
4. Sage (Billin, Sage 50 y otras soluciones)
Ideal para: negocios que ya trabajan con Sage o necesitan un entorno muy contable.
Sage ofrece distintos productos (Sage 50, Sage 200, etc.) y add-ons para facturación certificada VeriFactu.
Puntos fuertes
- Marca muy consolidada en contabilidad
- Ecosistema de partners y asesorías
- Enfoque robusto para empresas con departamento financiero
A tener en cuenta
- Entorno más complejo para autónomos y microempresas
- Los costes pueden ser elevados si necesitas muchos módulos o usuarios
- Integración con WooCommerce suele delegarse en partners externos
5. STEL Order
Ideal para: pymes que combinan fuerza comercial, servicios y facturación certificada.
STEL Order es un ERP en la nube con foco en movilidad, fuerza de ventas y, en los últimos años, en VeriFactu. Ofrece planes específicos para facturación certificada y también herramientas gratuitas orientadas a la adaptación.
Puntos fuertes
- Muy orientado a escenarios VeriFactu
- App móvil potente para equipos comerciales
- Planes y materiales específicos sobre la nueva normativa
A tener en cuenta
- Aunque puede conectarse con WooCommerce, no está tan centrado en tiendas online puras como otras soluciones
- Puede requerir configuración inicial más avanzada
6. Quipu
Ideal para: autónomos y pequeños negocios que priorizan modelos fiscales y relación con asesorías.
Quipu es un programa de facturación y tesorería que se ha posicionado con fuerza como solución VeriFactu para autónomos, ofreciendo envíos automáticos a la AEAT y materiales divulgativos.
Puntos fuertes
- Muy centrado en trámites fiscales y modelos
- Interfaz sencilla
- Preparado para VeriFactu
A tener en cuenta
- No es un ERP completo
- La gestión de stock o compras es limitada
- La integración con WooCommerce se basa en conectores externos y no cubre todo el flujo de negocio
7. Zoho Books
Ideal para: negocios que operan en varios países y usan ya el ecosistema Zoho.
Zoho Books se conecta con WooCommerce mediante integraciones (Zapier, plugins, etc.) y ofrece una plataforma contable y de facturación robusta.
Puntos fuertes
- Ecosistema completo (CRM, email, proyectos, etc.)
- Ideal si ya trabajas con otras herramientas Zoho
A tener en cuenta
- No está diseñado específicamente para la casuística fiscal española
- Para IVA, Recargo de Equivalencia o VeriFactu necesitarás parametrizaciones adicionales y, probablemente, apoyo de asesoría local
8. Alegra
Ideal para: freelancers y pequeños negocios digitales.
Alegra ofrece facturación online sencilla con conexión a WooCommerce mediante integraciones externas.
Puntos fuertes
- Interfaz simple y rápida de aprender
- Adecuado para facturación básica
A tener en cuenta
- No cubre la profundidad de un ERP (compras, stock, etc.)
- Para escenarios complejos (VeriFactu, multialmacén, varios canales de venta…) puede quedarse corto
9. ERPNext
Ideal para: proyectos open-source con equipo técnico.
ERPNext es un ERP libre con integración posible con WooCommerce a través de módulos personalizados.
Puntos fuertes
- Código abierto y muy flexible
- Sin licencias por usuario
A tener en cuenta
- Necesita servidor, mantenimiento y equipo técnico
- La adaptación a VeriFactu o TicketBAI requiere desarrollo a medida
- No es la opción más rápida si buscas algo “listo para usar”
10. Plugins de facturas dentro de WooCommerce (solo PDF)
Hablamos de extensiones como “WooCommerce PDF Invoices” y similares. No son programas de facturación como tal, sino generadores de PDF sobre los pedidos.
Puntos fuertes
- Económicos
- Fácil instalación
- Pueden servir como solución mínima en fases muy iniciales
A tener en cuenta
- No gestionan contabilidad ni libros fiscales
- No cumplen los requisitos de software certificado VeriFactu
- No están pensados para auditorías ni para crecer como ERP
Si quieres entender mejor por qué este tipo de soluciones no será suficiente con la nueva normativa, te interesa:
→ “Programas de facturación que cumplen VeriFactu”
3. Comparativa rápida
| Programa | Integración WooCommerce | Preparado para VeriFactu* | ERP completo | Nivel técnico recomendado | Mejor para… |
|---|---|---|---|---|---|
| FacturaONE | ⭐⭐⭐⭐⭐ | Sí | Sí | Fácil | Tiendas serias que quieren automatizar y cumplir normativa |
| Holded | ⭐⭐⭐⭐ | Sí | Sí | Medio | Pymes con contabilidad integrada |
| Odoo | ⭐⭐⭐⭐ | Depende del partner | Sí | Alto | Empresas medianas/grandes con IT propio |
| Sage (Billin / Sage 50) | ⭐⭐⭐ | Sí | Sí | Medio | Negocios ya acostumbrados a Sage |
| STEL Order | ⭐⭐⭐⭐ | Sí | Sí | Medio | Pymes de servicios y distribución |
| Quipu | ⭐⭐⭐ | Sí | No | Fácil | Autónomos orientados a fiscalidad |
| Zoho Books | ⭐⭐⭐⭐ | Adaptación adicional | Sí | Medio | Empresas que operan en varios países |
| Alegra | ⭐⭐⭐ | Limitado | No | Fácil | Freelancers y pequeños negocios |
| ERPNext | ⭐⭐⭐ | Desarrollo a medida | Sí | Alto | Proyectos técnicos open-source |
| Plugins PDF WooCommerce | ⭐⭐ | No | No | Fácil | Operación mínima / fase muy inicial |
*Según la información pública disponible de cada proveedor. Conviene comprobar siempre la documentación oficial antes de tomar una decisión.
Si quieres ver los plugins más usados (y cuándo se quedan cortos), aquí tienes el ranking completo:
→ Los 13 mejores plugins de facturación para WooCommerce
4. ¿Cuál es el mejor programa de facturación para WooCommerce?
La respuesta corta:
- Si quieres automatizar de verdad y cumplir normativa española:
👉 FacturaONE - Si buscas un macro-ERP y tienes presupuesto y equipo:
👉 Holded u Odoo - Si solo necesitas facturación básica sin visión de crecimiento:
👉 soluciones sencillas tipo Billin, Alegra o Quipu + conectores - Si quieres open-source y tienes equipo técnico:
👉 ERPNext
Si estás justo en ese punto de “mi sistema actual se queda corto”, esta guía te ayudará a decidir:
→ “Cuándo es el momento de cambiar de programa de facturación”
5. Pasos recomendados antes de elegir
- Revisa qué te exige Hacienda según tu caso
→ “¿A quién se aplica VeriFactu? Guía completa por territorios y excepciones”
→ “Guía TicketBAI para Bizkaia, Gipuzkoa y Álava” - Haz una lista de integraciones imprescindibles
WooCommerce, TPV, bancos, gestoría, etc. - Evita los errores típicos
→ “Errores comunes al elegir programa de facturación” - Planifica la migración de datos
Clientes, productos, históricos de facturas… - Prueba el software antes de decidir
Especialmente en escenarios reales: pedidos WooCommerce, facturas rectificativas, cambios de IVA, etc.
Si todavía estás montando la tienda (o estás comparando plataformas), te puede ayudar:
→ Cómo crear tu primera tienda online con WordPress y WooCommerce
→ ¿Puedo usar un dominio gratuito para mi tienda WooCommerce?
→ WooCommerce vs soluciones SaaS (Shopify, Wix, Squarespace)
6. Conclusión: WooCommerce + facturación profesional = negocio sano
WooCommerce es una plataforma potentísima, pero solo brilla de verdad cuando se apoya en un sistema de facturación profesional:
- Automatiza tus pedidos
- Cumple con VeriFactu y TicketBAI
- Gana tiempo y tranquilidad con Hacienda
- Ten una visión clara de tu negocio
Si quieres unificar todo en un mismo sitio —facturación, ERP, VeriFactu, TicketBAI y WooCommerce—, la opción más directa es:
👉 FacturaONE – ERP y programa de facturación para WooCommerce compatible con VeriFactu y TicketBAI
Si quieres ver qué plan encaja con tu volumen de pedidos y necesidades (WooCommerce, VeriFactu, TicketBAI, usuarios, etc.), puedes consultar las tarifas y planes de FacturaONE.
A partir de aquí puedes seguir reforzando el clúster con:

